南京市浦口区中医院始建于1988年，2013年9月成为二级甲等中医医院，2016年3月成为南京中医药大学教学医院，2018年4月成为江苏卫生健康职业学院教学医院，2019年11月挂牌南京市中医院浦口分院，现为江北地区唯一一所三级乙等中医医院，中国药科大学附属浦口中医院，江苏省口腔医院全科诊治专科联盟，南京中医药大学、安徽中医药大学、江苏健康职业学院教学医院，江苏医药职业学院实习基地。医院占地面积51亩，核定床位783张，开设病区21个，临床科室29个，医技科室12个。

医院现有国家中医优势专科建设单位1个（儿科），省级中医重点专科1个（儿科）、省级中医重点专科建设单位2个（肛肠科、骨伤科），市级中医重点专科8个（儿科、肛肠科、骨伤科、脑病科、脾胃科、呼吸内科、内分泌科、急诊科），市级中医重点专科建设单位2个（心内科、重症医学科）、市级医学重点专科2个（放射科、检验科），市级救治中心3个（胸痛、卒中、创伤）。在科研与学术方面，近两年医院共获国家自然科学基金5项、国家中医药管理局监测统计中心课题立项2项、省级课题5项，发表SCI论文23篇，举办省级继教班5场，学术影响力持续增强。

医院设备先进，配备有区内首台IQon彩色超高端光谱CT、256排CT及DSA、3.0TMRI、钼靶、超高端彩超等一大批涵盖检验、影像、治疗、手术、急救等多学科多领域的医疗设备。同时，医院不断优化和完善以电子病历为核心的医院信息系统，构建了涵盖HIS、LIS、PACS，电子病历等系统在内的数据平台，不仅满足了医疗、教学、科研工作的需要，更促进了业务技术水平的飞速发展。

2011年10月，区中医院改扩建工程奠基动工，项目总投资8个亿，总建筑面积81526.17㎡。2017年5月，改扩建项目一期新建门急诊楼投入使用；2017年12月，新建医技病房楼完工投入使用；2022年1月，13层儿童中心顺利投入使用；2024年12月口腔医学中心正式投入使用，医院发展再次迈入快车道。医院先后荣获中共南京市委先进基层党组织、南京市文明单位、南京市“推动高质量发展，争当示范引领”先进集体、浦口区高质量发展先进集体、浦口区推动一三五六总体发展布局先进集体等荣誉称号。